Асқазан және ішек ауруларын ауру тудыратын микроағзалар және вирустар тудыруы мүмкін. Көбінесе асқазан-ішек аурулары қайнамаған су, дұрыс жуылмаған көгөністер мен жеміс-жидектер, лас ыдыс-аяқ, кір қол және сақтау мерзімі өтіп кеткен тамақ өнімдері арқылы пайда болады.